18 Mayıs 2021 Salı 13:42
Tıbbi Genetik Anabilim Dalından başarılı bir bilimsel makale

Konu hakkında Dr. Öğretim Üyesi Onur Tokgün açıklamalarda bulundu;

"SARS-CoV-2 virüsünün bulaşma modellerini ve moleküler evrimini anlamak, hastalıkların önlenmesi için etkili ilaçlar ve aşılar üretmek için çok önemlidir. Bu nedenle, koronavirüslerin genomik dizilerinin analizleri, ilaç / aşı tasarımı için temel araçları oluşturmaktadır. Dünya genelinde virüs genom dizilerinin paylaşıldığı (GISAID) veri tabanında (https://www.gisaid.org/epiflu-applications/hcov-19-reference-sequence)  1,448,566 SARS-CoV-2 tam genom dizisi bulunmaktadır.

GISAID veri tabanından dünyanın her bölgesinden fazlasıyla SARS-CoV-2 genomu bulunmasına rağmen DENİZLİ ilimizden örnek bulunmamakta idi. Üniversitemiz Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinasyon Birimi tarafından Hızlı Destek projesi olarak desteklenmiş bu projemizde Denizli ilinden 15 adet Türk hasta örneğinden izole edilmiş SARS-CoV-2 genomu tam genom dizilerini ortaya çıkarmak için yeni nesil sekanslama (NGS) analizi gerçekleştirildi. Başarı ile tamamladığımız çalışmamız, The Journal of Infection in Developing Countries (JIDC) dergisinde bilimsel yayın olarak kabul gördü.

Çalışmamızda genetik benzerliklerini belirlemek için, Türkiye'deki SARS-CoV-2 genomlarının tamamı ve GISAID'den seçilen dünya çapındaki izolatlar dikkate alınarak filogenetik analizler yapılmıştır. Ayrıca, SARS-CoV-2 genomlarındaki mutasyonları göstermek için varyasyon analizleri de gerçekleştirilmiştir. Tüm deneysel ve biyoinformatik analizlerin tarafımızdan Tıbbi Genetik Anabilim Dalımızda gerçekleştirilen bu çalışmamızda veri tabanlarında % 0,01-0,03 sıklıklarında gözlenen nadir mutasyonlar saptanmıştır."

Dr. Tokgün, gerçekleştirdikleri çalışmanın gerek ilaç ve aşı tasarımı gerekse hastalığın seyrinin bölgesel farklılıklarının yorumlanmasında katkı sağlayacağını düşündüklerini de söyledi.

Son Güncelleme: 18.05.2021 13:47
Yorumlar
Avatar
Adınız
Yorum Gönder
Kalan Karakter:
Yorumunuz onaylanmak üzere yöneticiye iletilmiştir.×
Dikkat! Suç teşkil edecek, yasadışı, tehditkar, rahatsız edici, hakaret ve küfür içeren, aşağılayıcı, küçük düşürücü, kaba, müstehcen, ahlaka aykırı, kişilik haklarına zarar verici ya da benzeri niteliklerde içeriklerden doğan her türlü mali, hukuki, cezai, idari sorumluluk içeriği gönderen Üye/Üyeler’e aittir.